Blick vom Warnow-Nordufer am Stadthafen – ungefähr an der Grenze der Ortsteile Dierkow (links) und Gehlsdorf (rechts) – auf die Innenstadt.
Am 1. Januar 2026 fusionierte die Ev.-luth. Innenstadtgemeinde mit der Slütergemeinde Rostock-Dierkow und der St.-Michaels-Gemeinde Rostock-Gehlsdorf zur Ev.-luth. Jakobusgemeinde Rostock. Sie hat rund 5.500 Gemeindeglieder.
Zur Geschichte der früheren Innenstadtgemeinde: Diese entstand im Jahr 1998 durch Fusion aus den Gemeinden Marien-Jakobi und Petri-Nikolai. Diese beiden Vorgängergemeinden bildeten die gleichnamigen Pfarrbezirke der späteren Innenstadtgemeinde.
Das Gemeindegebiet umfasste den Stadtteil Mitte sowie den größten Teil von Brinckmansdorf und den östlichen Rand der Kröpeliner-Tor-Vorstadt. Die Innenstadtgemeinde gehörte zur Propstei Rostock und war mit zuletzt ca. 3.800 Gemeindegliedern die größte im Kirchenkreis Mecklenburg. Der Kirchenkreis ist wiederum Teil der Evangelisch-lutherischen Kirche in Norddeutschland, der sogenannten Nordkirche>>.
Im Gemeindegebiet liegen zahlreiche Senioreneinrichtungen, von denen einige auch gottesdienstlich versorgt werden. Die Gemeinde war bis 2023 Trägerin einer Kindertagesstätte in der Östlichen Altstadt.
Mit der Fusion 2026 ist das Gemeindegebiet um die Rostocker Ortsteile Gehlsdorf und Dierkow (Dierkow-Neu, Dierkow-Ost, Dierkow-West, Hinrichsdorf, Nienhagen und Peez) gewachsen. Hinzugekommen ist mit dem Siftung Michaelshof> in Gehlsdorf und Dierkow eine wesentliche diakonische Einrichtung der Region.
Die Gehlsdorfer Kirchengemeinde war 1913 aus der Gemeinde Toitenwinkel ausgegliedert worden. Der Kirchsaal entstand 1903.
Die Slütergemeinde Dierkow wurde 1950 als Ausgliederung der Petri-Gemeinde gegründet. Im zwischen 1935 und 1937 angelegten Stadtteil wurde 1951 das Slüterhaus als Pfarr-und Gemeindehaus errichtet,
Im Gemeindehaus Friedhofsweg 49 betreibt die Jakobus-Kirchengemeinde als Station auf der Via Baltica des „Baltisch-Westfälischen Wegs“ und des „Baltisch-Mitteldeutschen Wegs“ eine Pilgerherberge>.
Die Petrikirche beherbergt im Gustav-Adolf-Saal die Jugendkirche Rostock>.
Es bestehen bzw. bestanden partnerschaftliche Kontakte der Innenstadtgemeinde zu Gemeinden in Emmen (NL), München-Harthof (Versöhnungsgemeinde), Nürnberg-St. Lorenz und Flensburg-Engelsby. Die Gehlsdorfer Gemeinde unterhält eine lebendige Beziehung zur Diakoniestation SANDORA in Silute, Litauen.
Seit einigen Jahren beteiligte sich die Innenstadtgemeinde am wöchentlichen Friedensgebet der Versöhnungslitanei von Coventry, das an vielen Orten weltweit freitags gebetet wird. Im Herbst 2018 wurde die Innenstadtgemeinde in die Reihe der Zentren der in Coventry begründeten Nagelkreuz-Gemeinschaft>> aufgenommen.
Die zentrale Lage ihrer größeren Kirchen bringt es mit sich, dass die Jakobus-Kirchengemeinde an verschiedenen übergeordneten Veranstaltungen im kirchlichen, kommunalen und kulturellen Bereich beteiligt ist.
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